天津服务表观遗传组测序结果

时间:2022年02月16日 来源:

1、DNA甲基化富集峰的识别 通过高通量测序和生物信息分析,识别甲基化富集的基因组区域,默认p <= 1e-5(具体参数以报告为准,云序生物会根据数据,适当调整参数)的峰为统计上明显的甲基化区 注:每个样品组做一个Input,以去除基因组背景,降低假阳性率 2、DNA甲基化区域富集峰的注释 富集峰识别后,得到的是一堆基因组位置信息,通过生物信息分析利用邻近基因对富集峰进行注释,并根据峰中点相对于已知基因的位置,将富集峰为启动子峰、上游峰、内含子峰、外显子峰、基因间峰云序生物具有丰富样本处理经验,采用ctDNA提取试剂盒,富集效率高。天津服务表观遗传组测序结果

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报道表明:ctDNA羟甲基化不但可以作为tumsor分子标志物,还可用于追溯tumsor细胞的组织来源。在医疗大趋势下,ctDNA羟甲基化检测既具有极高的科研价值,又具备推进医疗临床实践的巨大潜能,为实现tumsor临床医治的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA羟甲基化测序,凭一管液体就可以进行tumsor诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等,是里程碑式的新型液体活检技术。 云序生物率先推出ctDNA羟甲基化测序服务,低需1ng ctDNA既可进行测序。客户需提供血浆,血清或体液样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。辽宁研究表观遗传组测序内容通过对不同产后时间点的胎儿环状DNA含量的评估。

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案例1:解析组蛋白修饰 原文:Epigenomic analysis of multilineage differentiation of human embryonic stem cells 期刊:Cell 影响因子:31.39 为了研究胚胎发育过程中的表观遗传调控,本文结合ChIP测序、甲基化测序和转录组测序,系统性地调查了人类胚胎干细胞在分化为不同类型细胞过程中的染色体修饰、DNA甲基化修饰以及转录组变化。通过各种测序数据的联合分析发现:胚胎发育早期活跃的启动子CpG含量比较高,并且在不表达的细胞中它们往往具有组蛋白H3K27me3修饰,从而维持抑 制状态。相反地,胚胎发育后期表达的基因的启动子CpG含量比较低,并且主要通过DNA甲基化维持抑 制状态。

DNA甲基化是基因组一种主要的表观遗传修饰形式,它能够调控基因表达、染色质稳定性、X染色体失活及抑制病 毒和外源基因的表达等生物过程,与人类的ai症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学研究中的热点之一。 云序生物提供新一代的DNA甲基化芯片Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip测序服务(下文中以850K芯片代称)。850K甲基化芯片有效的利用高通量筛选技术,不但实现基因区域和CpG岛的覆盖,还包括 CpG 岛之外的甲基化位点、在人类干细胞中鉴定出了非 CpG 甲基化位点、miRNA 启动子区域、以及tumsor和正常组织中差异表达的甲基化位点等。普遍应用于ai症、tumsor和其他复杂疾病的研究,是目前适合表观基因组全关联分析研究的全基因组DNA甲基化芯片。血清、血浆、体液样品,液氮速冻后-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。

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案例1. ATAC-Seq与RNA-Seq关联分析 期刊:The Plant Cell 影响因子:8.23 原文:EGRINs (Environmental Gene Regulatory Influence Networks) in Rice That Function in the Response to Water Deficit, High Temperature, and Agricultural Environments 本篇文章是利用ATAC-seq与RNA-seq联合分析的经典案例。作者选择5个不同的水稻品种,对它们分别进行热处理和干旱处理以模拟高温和缺水这2种胁迫环境。进一步通过对这种胁迫处理的5个水稻品种进行RNA-seq检测RNA的表达差异和ATAC-seq检测染色质开放区域差异。再联合ATAC-seq数据和RNA-seq数据,以及转录因子的motif信息。构建植物应激的转录因子-靶基因的调控网络图,并寻找关键的转录因子-靶基因模块,预测了关键转录因子活性。完成植物在应激情况下反应相关的转录因子的研究。可用于协助评估用药疗效、复发及医治后期转移动态的监测。青海研究表观遗传组测序平台

促进tumsour细胞演进和适应性进化,增加了基因组的可塑性和不稳定性。天津服务表观遗传组测序结果

优势一:一站式服务。客户只需提供样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 优势二:超微量ctDNA 起始量要求。云序生物可以进行低至 10 ng 的 ctDNA 测序。 优势三:测序数据真实可靠。云序生物避免了传统 5mC 检测方法的 GC 覆盖度偏误,还拥有更完整的 DNA 读长,文库质量更加可靠。 优势四:严格质控流程:云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。 优势五:专业化生物信息分析:云序生物强大生物信息团队,满足客户个性化数据分析要求。天津服务表观遗传组测序结果

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