石家庄云序m1A

MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供，是在已发表实验方法的基础上开发而来，方法简述如下：片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用protein A磁珠（Thermo Fisher）在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂（Thermo Fisher）进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒（NEB）建库，并在Illumina Hiseq测序仪上进行双端150bp测序。作者将筛选的HIV病毒逆转录酶应用于m1A-seq中，并分别在rRNA和tRNA中检测了m1A的突变特征。石家庄云序m1A

目前对m1A甲基化修饰研究的报道是发表在Molecular Cell上的一篇论文。该研究通过单碱基分辨率方法“m1A RNA甲基化测序”鉴定了细胞核和线粒体中 m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数 m1A 甲基化修饰富集在 mRNA的 5’UTR，小部分符合“GUUCRA”基序的 m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外，线粒体编码的转录本中也有大量的 m1A 甲基化修饰。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。邯郸m1A平台RNA甲基化位点motif分析。

RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程，目前对m6A RNA甲基化的研究已进行的如火如荼，但除了m6A以外仍有多种热门RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰，在这些领域的研究极具潜力，近期不断有高影响因子文章的出现（如表1）。云序生物是国内RNA修饰测序的先驱，可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。目前，云序已累计支持客户发表25篇高水平文章，合计影响因子171.6分，是国内支持发文较多、累计影响因子较高的公司。

为了研究人细胞转录组中的m1A修饰，伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量，发现其guang泛存在于各种细胞系中。该研究继而通过化学生物学、高通量测序等手段，发展了“m1A-ID-seq” 一种结合抗体富集和特异性酶促反应的m1A RNA甲基化测序新技术。利用这一技术，该研究成功实现了人细胞系全转录组水平的高分辨率m1A检测，鉴定出901个含有m1A修饰的转录本，并且发现m1A呈现强烈的5’非转录区分布特异性。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。

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这一分布规律与m6A（真核细胞mRNA中广fan的甲基化修饰）截然不同，后者主要集中在mRNA的靠后一个外显子上，并且对mRNA的翻译、定位、稳定性等多个过程进行调控。该研究进一步鉴定了m1A修饰的一个去甲基化酶ALKBH3，并发现了转录组中ALKBH3的近千个作用位点。因此，该研究不但揭示了m1A的广fan存在、绘制了转录组中m1A RNA修饰的谱图，也为m1A修饰参与基因表达调控的研究提供了重要工具。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，石家庄云序m1A