海淀区m1A分析

时间:2022年03月07日 来源:

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RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。日益增多的发表文章、特别是高分文章说明,这个领域现在正在迅速成为大家关注的焦点。RNA甲基化修饰类型很多,目前热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RNA甲基化﹑m1A RNA甲基化。而m1A RNA甲基化是一个新进入大家的视野的RNA甲基化修饰类型,即 RNA 分子腺嘌呤第 1 位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,东城区m1ANature:真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究。

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案例3:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰-Base-Resolution,期刊:Molecular Cell 影响因子:13.84,本研究通过单碱基分辨率方法的m1A RNA甲基化测序技术鉴定了细胞核和线粒体中m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR,小部分符合“GUUCRA”基序的m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外,线粒体编码的转录本中也有大量的m1A 甲基化修饰。该研究还表明,位于5’UTR 区,尤其是转录本di一和第二位上的m1A 可促进mRNA 翻译,而位于编码区的m1A 可抑 制翻译作用。因此,m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A 甲基化修饰,还为进一步m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰。

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在m1A领域,云序生物是国内一家有文献发表的测序服务平台。2020年8月,云序客户在Plant physiology发表了矮牵牛m1A甲基化修饰文章,其中的m1A测序和相关数据分析均由云序提供。这个新领域的研究进展如何?有哪些新型的方法思路值得我们借鉴呢?小编汇集了近期多篇m1A修饰文章,带大家把握这一领域的前沿进展。1.m1A——矮牵牛mRNA中m1A修饰的动态变化(云序客户文章),2.对不同RNA修饰调控作用的新见解:重新定义转录和翻译之间的桥梁,3.m1A——寡核苷酸质谱法guang泛的应用于体外分析甲基化酶和去甲基化酶。目前对m1A甲基化修饰研究的报道是发表在Molecular Cell上的一篇论文。海淀区m1A分析

与m6A RNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术。海淀区m1A分析

此研究由云序生物合作客户华南农业大学余义勋课题组完成的,该课题组利用m1A-seq & RNA-seq(本实验云序提供)技术对矮牵牛花瓣中含m1A修饰的RNA进行全转录组分析,发现乙烯处理降低了花瓣mRNA m1A峰的水平。另外还发现矮牵牛tRNA特异性甲基转移酶61A (PhTRMT61A)的沉默降低了体内和体外mRNA的m1A水平,定位于细胞核内的PhTRMT61A被抑制会导致叶片发育异常。这些研究结果显示RNA m1A修饰可以作为表观转录组调控机制并在植物生长发育中起着重要作用。矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,云序生物热门RNA修饰—m5C甲基化。海淀区m1A分析

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