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案例1：m5C RNA甲基化调控mRNA出核新机制 原文：5-methylcytosine promotes mRNA export — NSUN2 as the methyltransferase and ALYREF as an m5C reader 期刊：Cell Research 影响因子：15.60 中科院汪海林等研究团队揭示了m5C修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。研究人员建立了改进的RNA m5C单碱基分辨率高通量测序与生物信息分析技术，以此揭示mRNA m5C的分布规律，并绘制了精细的m5C修饰图谱，发现m5C在mRNA的翻译起始位点下游有明显富集，并且主要分布于CG富集区域。通过分析对比人和小鼠不同组织，发现m5C在mRNA上的分布特征在哺乳动物中十分保守，而在不同组织中修饰的基因具有特异性。研究团队同时发现，在小鼠睾丸发育过程中，动态的m5C修饰基因明显富集于精子发育相关功能，提示m5C修饰参与生殖发育调控。m6A修饰在各种真核生物、各类组织细胞中普遍存在。dna羟甲基化的
ac4C RNA乙酰化是在RNA ac4C修饰酶的作用下，使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰（N4-acetylcytidine）。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上，导致Watson-Crick碱基热稳定性增加，调控蛋白合成中的编码准确性；近期研究发现ac4C分布在人类转录组中，大多数位点出现在编码序列（CDS）内，并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前，ac4C RNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰，是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”！黑龙江超微量RNA甲基化m7G MeRIP测序方式，采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程，具有极高的效率和特异性。
植物中m6A修饰的研究主要集中在拟南芥的生长发育上。然而，拟南芥是一种盐敏感模式植物。因此，有必要对m6A修饰在高耐盐作物的盐胁迫响应中的作用进行研究。甜高粱是一种能源和饲料作物，非常适合在盐碱地生长。探讨m6A在甜高粱中的修饰对阐明作物的耐盐机理具有重要意义。在本研究中，作者检测了在耐盐性不同的两个高粱基因型(耐盐的M-81E和盐敏感的Roma)中m6A的修饰。甜高粱在盐胁迫下的m6A修饰发生了剧烈的变化，特别是在Roma中，一些耐盐相关转录本的m6A修饰增加，导致mRNA稳定性增强，进而参与了甜高粱耐盐性的调控。虽然m6A修饰对甜高粱的耐盐性具有重要的调控作用，但其调控活性受初始m6A修饰水平的限制。
云序优势 一站式服务 客户只需提供组织、细胞、体液样品或RNA，云序生物为您完成从ac4C RNA富集，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。 抗体富集效率高 acRIP-seq的富集效率是决定数据质量的关键，云序生物acRIP-seq实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程，具有极高的效率和特异性。 分子全覆盖 可检测mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多类RNA分子ac4C乙酰化位点。 严格的质控 云序生物对acRIP-seq实验每一步骤均设有关键质控，全程监控实验质量，保证客户得到数据。 专业的生物信息学分析 云序生物拥有专业的生物信息分析团队，帮助客户进行实验数据的挖掘。 RNA乙酰化测序与转录组联合应用 可整合RNA乙酰化数据和转录组数据进行生物信息学关联分析，揭示RNA乙酰化对基因表达调控的影响，深入挖掘RNA乙酰化的功能。 云序生物率先开展m5C RNA甲基化测序服务，采用经典重亚硫 酸盐处理的方式进行测序。
案例3：拟南芥m5C RNA甲基化谱及TRM4B酶对根的影响 原文：Transcriptome-Wide Mapping of RNA 5-Methylcytosine in Arabidopsis mRNAs and Noncoding RNAs 期刊：The Plant Cell 影响因子：8.23 与上篇不同，本研究团队采用m5C RNA甲基化测序研究拟南芥中m5C甲基化谱，在种子，幼芽，根中发现了1000多个特异性的位点。敲低RNA m5C甲基转移酶TRM4B，造成tRNA稳定性的降低。研究人员还证实TRM4B突变体的初级根比野生型更短，同时对氧化的应激反应更敏感。包括：mRNA 5’帽子结构、mRNA内部、pri-miRNA、转运RNA（tRNA）和核糖体RNA（rRNA）。黑龙江DNA甲基化
2’-O-RNA甲基化修饰在mRNA、tRNA、rRNA、miRNA等分子上分布。dna羟甲基化的
案例2：METTL1通过m7G甲基化促进let-7 MicroRNA的加工 原文：METTL1 Promotes let-7 MicroRNA Processing via m7G Methylation 期刊：Molecular Cell 影响因子：14.25 剑桥大学戈登研究所和病理学系中心，借助m7G RNA甲基化测序技术，识别了A549细胞中miRNA具有m7G甲基化修饰。该研究发现Mettl1调控的pri-let7 m7G修饰通过改变pri-let7中G-四重结构，进一步调控pre-let7和let7的表达，影响肺ai细胞迁移。该研究揭示了Mettl1依赖的m7G甲基化修饰可以作为调控miRNA结构、生物发生和细胞迁移的一种新的RNA修饰。dna羟甲基化的