朝阳区上海云序生物m1A
RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰,在这些领域的研究中也不断有高分文章的出现。云序生物是国内RNA修饰测序的ling跑者,可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。全转录组水平测序揭示可逆与动态的m1A RNA修饰。朝阳区上海云序生物m1A
样本要求:样品类型:组织、细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。样品量:细胞: > 1×108,组织: > 5 g ,总RNA:> 300 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5;无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾 28S:18S≥1.5或者RIN≥7),样品运输及保存:样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成5-10 mg的小块),可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后,-80℃保存,RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,样品保存期间避免反复冻融。邯郸m1A分析上海,北京,广州,天津、福建、广东,广西。
2. m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测,发现了740个m1A修饰位点,其中473个位点位于mRNA和lncRNA,大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库,作者还排除了假阳性结果。另外,作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关,且这种正相关性在cap+1位置上更xian著,但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析,作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外,作者发现TRMT6/61A不仅是tRNA m1A甲基化酶复合物,也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。
案例3:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰-Base-Resolution,期刊:Molecular Cell 影响因子:13.84,本研究通过单碱基分辨率方法的m1A RNA甲基化测序技术鉴定了细胞核和线粒体中m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR,小部分符合“GUUCRA”基序的m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外,线粒体编码的转录本中也有大量的m1A 甲基化修饰。该研究还表明,位于5’UTR 区,尤其是转录本di一和第二位上的m1A 可促进mRNA 翻译,而位于编码区的m1A 可抑 制翻译作用。因此,m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A 甲基化修饰,还为进一步m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。试剂盒哪家好,上海云序生物,您的选择。
何川教授助力m1A甲基化修饰研究。2019年9月23日,美国芝加哥大学Bryan C. Dickinson团队与何川团队在Nature Methods上发表“Evolution of a reverse transcriptase to map N1-methyladenosine in humanmessenger RNA”研究成果,该项研究开发并验证了一个逆转录酶进化平台,可快速选择逆转录酶,使其在逆转录过程中越过RNA修饰位点,并使其发生突变,从而特异性识别RNA修饰。该平台首先被应用到了对m1A修饰的检测,在测序过程中产生突变标记,终实现单碱基识别m1A,为m1A生物学的研究提供了新的工具、分析方法和数据集。RNA甲基化富集峰可视化图。东城区m1AmRNA测序
作者将筛选的HIV病毒逆转录酶应用于m1A-seq中,并分别在rRNA和tRNA中检测了m1A的突变特征。朝阳区上海云序生物m1A
该研究还表明,位于 5’UTR 区,尤其是转录本di一和第二位上的 m1A 可促进 mRNA 翻译,而位于编码区的 m1A 可抑制翻译作用。因此,m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的 m1A 甲基化修饰,还为进一步 m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。m1A 修饰作为一类新型 RNA 甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。云序生物作为m1A RNA甲基化研究的先驱者,能够为客户提供专业和优zhi的m1A RNA甲基化测序服务。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,朝阳区上海云序生物m1A