蓟州区m1A全转录组测序

时间:2022年03月11日 来源:

MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供,是在已发表实验方法的基础上开发而来,方法简述如下:片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用protein A磁珠(Thermo Fisher)在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂(Thermo Fisher)进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒(NEB)建库,并在Illumina Hiseq测序仪上进行双端150bp测序。m1A测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A甲基化修饰。蓟州区m1A全转录组测序

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Molecular Cancer (IF=10.679)杂志刊登了m6A修饰研究:m6A依赖的糖酵解增强结直肠ai(CRC)发生。该文章采用多组学联合应用技术检测了Mettl3-KO(m6A甲基化转移酶敲除细胞株)和WT HCT116(结直肠ai细胞株)甲基化修饰,这项研究揭示METTL3通过m6A-IGF2BP2/3-依赖性机制稳定HK2和SLC2A1 (GLUT1)在CRC中表达,表明m6A修饰的糖酵解途径可以促进结直肠ai的发展,同时为以METTL3及其途径为靶点高糖代谢的CRC患者提供了合理的zhi疗靶点和zhi疗方向。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。蓟州区m1A平台目前对m1A甲基化修饰研究的报道是发表在Molecular Cell上的一篇论文。

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为了探寻m6A修饰与结直肠ai(CRC)的糖酵解代谢的相关性,采用qPCR检测结直肠ai患者体内脱氧葡萄糖吸收(FDG uptake)和m6A修饰相关酶表达的情况,发现Mettl3(m6A甲基化转移酶)的表达与FDG摄取存在明显的相关性。同时检测到在CRC体内Mettl3高表达和葡萄糖代谢强烈保持一致,那么在结直肠ai患者体内FDG和Mettl3的变化是否影响甲基化整体水平的变化呢?作者采用多种方法检测高FDG CRC和低FDG CRC患者体内甲基化水平,结果表明m6A修饰水平在这些FDG摄取较高的CRC患者中也xian著升高。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。

m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。研究表明,m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。与m6ARNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,抗体富集的技术原理如下:将m1ARNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。云序生物为您完成从m1A RNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。

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这家公司项目负责人不错,很细心也很耐心,之前陪我朋友去咨询过,云序生物的RNA甲基化项目的负责人真的很好,我朋友提出的疑虑都能认真的回答解说,我朋友也是经过多家对比之后还是觉得云序生物不错,选择跟云序生物合作,云序生物的口碑在RNA甲基化行业内还不错,你要先了解自己的需求,以及购买的预算然后再能选择,建议与他们的销售人员多沟通沟通,在这家做了m6a测序,实验做的很漂亮,很满意。后期如果还有实验要做应该还是会选他们家的。细胞样品或新鲜组织块(切成5-10 mg的小块),可用TRIZOL或RNA保护剂处理。大同m1A结果

全转录组水平测序揭示可逆与动态的m1A RNA修饰。蓟州区m1A全转录组测序

研究表明,m1A 是真核生物 tRNA 和 rRNA 丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明 m1A 修饰可调控 mRNA 翻译。m1A 修饰作为一类新型 RNA 甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。云序生物作为m1A RNA甲基化研究的先驱者,能够为客户提供专业和优zhi的m1A RNA甲基化测序服务。我们承接上期的m5C RNA甲基化,为大家带来m1A RNA甲基化研究进展。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。蓟州区m1A全转录组测序

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