研究测序平台

样本要求： 样品类型： 细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。 样品量： a) 细胞：2×107 b) 组织：100 mg-1 g c) RNA：30-300 μg（OD260/280：1.6-2.3；RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7） 样品运输及保存： 样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。 样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。云序生物对O8G RNA氧化化检测手段为O8G-IP-Seq技术。研究测序平台

云序生物率先推出ctDNA甲基化测序服务，低需1ng ctDNA既可进行测序。客户只需提供血浆，血清或体液样本，云序生物为您完成从ctDNA提取，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。 云序生物率先推出两种ctDNA甲基化测序服务。（1）免疫共沉淀测序（MeDIP-Seq）：通过5mC抗体特异性抓取基因组上发生甲基化的ctDNA的片段，并结合高通量测序技术，高性价比检测ctDNA甲基区域；（2）单碱基测序（Bis-Seq）：采用经典重亚硫 酸盐处理的方式，未发生甲基化的C碱基会转换成U，发生甲基化的C碱基还是C，并结合高通量测序技术，可对ctDNA甲基化进行单碱基精确定位。西藏测序pri-miRNARNA抽提，RNA质控，环状RNA特异性引物设计，环状RNA逆转录，环状RNA qPCR检测。

案例1：全外显子测序在ai症研究中的应用 胰腺导管腺ai(PDA)的预后非常差，因此对其病原学的研究以及靶向干预医治非常必要。本文对109个显微切割的PDA组织样品进行了全外显子测序。研究表明：环境压力以及DNA修复基因的改变与不同的突变谱有关联。许多ai基因/抑ai基因位点发生了拷贝数变化，但只有MYC基因拷贝数扩增与比较差的预后以及腺鳞ai亚型相关。此外，作者还在PDA中发现了多个新的突变基因，其中一些与预后相关。RBM10突变往往预示着较长的生存期。90%以上的样品中发生了KRAS的突变，但只有密码子Q61的等位突变与较长的生存期相关。此外，Wnt信号通路，染色质重塑信号通路，Hedgehog信号通路，DNA修复和细胞周期相关的基因也被发现有较高的突变频率。这些数据表明了不同PDA样品的基因组多样性，并且找到了一些与预后相关的基因以及医治靶点。

mRNA m6Am-Exo-seq 测序服务 云序生物在国内首批引入 m6Am-Exo-seq 测序服务，利用 5’ 核酸外切酶消除非目的性的 RNA的 片段上 m6A 修饰的信号干扰，选择性地获取 mRNA 5’ 帽子结构下游 m6Am 修饰富集区域的序列信息。对选择性获取到的 m6Am 修饰的 RNA 的片段进行反转录建库和高通量测序，可为后续的生物信息学分析提供丰富的数据，进而揭示差异性 m6Am 修饰位点的特征及其可能的生物学功能，为您的科研课题提供强劲的助力。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。云序生物拥有受行业认可的BD Rhapsody™单细胞测序平台。

环状DNA形成的机理 目前研究表明，环状DNA是从染色体上断裂、环化或者额外复制产生的序列，其剪切加工机理主要提出有两种可能：（1）通过染色体异位同源重组环化（intrachromatid ectopic homologous recombination，HR）；（2）通过非同源染色体末端连接环化（nonhomologous end-joining，NHEJ）。环状DNA形成是一个复杂的过程，更多环化方式有待探索。针对血清血浆微量样品，云序生物参考卢煜明教授团队开发的方法，酶切去除线性DNA后，利用Tn5转座酶，打开环状DNA环状结构并同时在DNA的片段两端加上接头，进行建库及测序。云序生物可进一步提供高精度的O8G氧化图谱。福建测序环状RNA

环状DNA是从染色体上断裂、环化或者额外复制产生的序列。研究测序平台

案例1：小肠腺ai的特异性甲基化组图谱 本文通过MeDIP测序研究了小鼠模型小肠腺ai起始过程中的甲基化变化，发现了13,000多个与小肠腺ai发生相关的差异甲基化区（DMRs）。进一步分析发现：组蛋白修饰复合物PRC2的靶基因在高甲基化DMRs中明显富集，说明组蛋白修饰与DNA甲基化密切相关。此外，在不同类型细胞中，通过重亚硫 酸盐焦磷酸测序证实：这些DMRs是腺ai细胞中全新形成的，而不是通过小肠干细胞或未分化隐窝细胞中已有甲基化模式的扩展形成的。更为有趣的是，作者发现了一些DMRs，它们在小鼠腺ai和人类结肠ai间是保守的，并因此找到了一些在结肠ai中受表观遗传修饰的基因，揭示了甲基化修饰作为临床分子标志物的潜力。研究测序平台