江西技术表观遗传组测序案例

时间:2022年07月14日 来源:

EM-seq 的优势相比于传统的WGBS 拥有多种优势: DNA 测序文库质量高、所需 DNA 起始量小 相比于WGBS,EM-seq 对 DNA 的损伤小,因此可以用更少 DNA 样品、更少的 PCR 轮数扩增出高质量的测序文库。云序生物提供的 EM-seq 服务,所需的 DNA 起始量可低至10ng。 DNA 文库的插入片段更长、更完整 相比于WGBS,EM-seq 处理后的 DNA的片段更完整,长度更长,避免产生测序缺口。出色的 GC 覆盖均一性 无论 GC 程度高低,EM-seq 的覆盖度都有均匀且优良的表现;相比之下,WGBS 测序文库高估了 AT 区,却低估了 GC 区,造成“GC 覆盖度偏误”。近日,Nature杂志上发表了颠覆性研究成果:在tumsour中,主要的ai基因转录本是直接来自于环状DNA的。江西技术表观遗传组测序案例

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技术简介 DNA甲基化能控制基因表达,因而在动植物的生长发育过程中发挥着关键的调控作用,并且与包括ai症在内的多种人类疾病密切相关,是表观遗传学研究的热点。 云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。配合强大的生信分析实力,我们提供的不仅是海量的测序数据,而且是根据您的研究目的,有针对性地挖掘提炼出取之即可用的结果及出版级图片。吉林技术表观遗传组测序分析此外,和胎儿线性DNA类似,胎儿环状DNA在分娩后从母血中迅速分离。

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不同于已经得到深入研究的基因组 DNA 的表观遗传修饰,ctDNA 的 5mC 甲基化修饰研究仍然是一个未被充分探索的领域,对于科研者来说是一个尚待挖掘的金矿。既然如此,那我们是不是可以按图索骥,直接将基因组 DNA 甲基化修饰研究的传统方法照搬到 ctDNA 的5mC 甲基化修饰研究上来呢?答案是否定的:因为 ctDNA 含量低、缺乏染色质结构的保护,若直接将研究基因组 DNA 的 5mC 修饰的传统方法应用于 ctDNA,则会遇到南橘北枳的困境,云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。

可以说,ctDNA的应用已经渗透到tumsor全程管理的各个环节。 早期筛查:与甲基化检测结合,或能较早检出tumsor的发生;技术不断成熟,有望使其成为tumsor早筛的新方法。 分子诊断:用于组织学检测的替代或有效补充,检测已知的驱动基因,如肺cancerEGFR、ALK突变等,指导医治。 残余病灶检测:可基于ctDNA,进行术后分子残留病灶检测,并进一步预测巩固医治的疗效。 疗效评估:系列、动态的检测ctDNA中的基因突变情况(如EGFR突变丰度),有效评估tumsor通路状态,评估靶向医治的疗效。ctDNA甲基化基因的有效性(AUC:0.816)远高于传统分子标志物AFP(AUC:0.969)。

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人体血液循环系统中,含有不断流动的携带一定特征(包括突变,缺失,插入,重排,拷贝数异常,甲基化等)的,来自tumsor基因组的DNA的片段。这些DNA的片段来源于四个部分:1、坏死的tumsor细胞;2、凋亡的tumsor细胞;3、循环tumsor细胞;4、tumsor细胞分泌的外排体。自1977年人类发现ctDNA以来,对其的研究就从未中断过。在1994年,研究人员鉴定了来源于tumsor的含有cancer标志性突变的DNA。加上ctDNA的无创性和易获得性,在其中发现的tumsor标志物,被认为可以用于检测tumsor早期诊断,进展过程,预后判断及个性化用药指导。但是由于ctDNA在人体血液内含量极低,只有循环DNA的1%,甚至万分之一,其测序检测存在巨大的挑战。cfDNA是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中的降解的DNA小片段。江西修饰表观遗传组测序分子

甚至会对传统遗传学和基因组学带来**性影响。江西技术表观遗传组测序案例

技术简介DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine,5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,一种新的DNA甲基化修饰类型—DNA-6mA甲基化已经成为表观遗传学领域的研究热点。云序生物率先开发了DNA-6mA测序技术—6mA-IP-seq。其原理类似于MeDIP的免疫共沉淀测序技术,利用特异性抗体富集6mA的片段,扩增后进行高通量测序及甲基化分析,以较小的数据量,快速地绘制全基因组DNA甲基化水平的图谱。江西技术表观遗传组测序案例

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