陕西m6a环状测序
环状RNA作为一种新发现的非编码RNA,在多种组织及疾病中发挥重要的生物学功能,然而关于其在红斑狼疮性肾炎中的研究鲜有报道。红斑狼疮性肾炎作为一种免疫缺陷性疾病,严重影响了患者的身体健康和生活质量。云序携手中国医科大学周华主任团队在Cell子刊“Molecular Therapy Nucleic Acids”上发表重要研究成果,通过全转录组测序构建了该疾病的环状RNA表达谱,并从313条差异表达结果中挑选感兴趣的环状RNA--CircHLA-C。前期,作者发现miR-150在该疾病中发挥着重要的调控作用,通过生信预测结果显示该环状能够通过竞争性吸附miR-150。云序生物环状RNA测序服务,采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit。陕西m6a环状测序
胶质瘤作为较常见的颅内恶性tumour占颅脑tumour的40%~50%,电磁辐射等其他环境致cancer因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤医治手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的医治造成很大的困难。上海第二军医大学附属长征医院研究者通过环状RNA测序,从环状RNA角度对胶质瘤的发生和发展进行了研究, 共发现206个上调环状和1205个下调环状,其中扩大样本量qPCR验证(13例正常、68例疾病)后将目标锁定在circBRAF。该环状转录自BRAF基因,虽然在正常人样本当中BRAF基因编码的环状cricBRAF分子mRNA分子水平无明显差异,但是在疾病样本当中circBRAF有明显上调,KM曲线结合临床资料表明该环状的高表达能一定程度上预示着疾病的恶性程度和预后情况。天津外泌体环状环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子,也是RNA领域新的研究热点。
研究二:环状RNA分子细胞表型 作者发现Cia-cGAS是由D430042O09Rik的4、5、6号外显子连接成环。且位于外显子上下游的内含子区域具有成环所需高度同源序列。作者通过Cas9技术手段,敲除一端同源序列后,成功获得Cia-cGAS 敲除小鼠模型。敲除小鼠中LSK祖细胞明显增多,LT-HSC明显减少,且基因敲除小鼠出生6个月后会死于贫血。对基因敲除小鼠中LT-HSC进行BrdU染色,结果说明敲除小鼠中LT-HSC细胞处于增殖分裂活跃期。同时脉冲标记H2B-GFP小鼠模型证实Cia-cGAS敲除后,静息状态的LT-HSC细胞比例明显降低。
人、大鼠、小鼠来源的环状研究已经取得了一定进展,农学背景的云序客户也在自己擅长的生物标本中进行了环状RNA研究,证明了环状在多个物种当中都起到了重要的生物学作用。河南农业大学研究团队出环状分子可以调控小麦在环境压力下对光合作用、卟啉、叶绿素代谢、氧化磷酸化以及氨基酸的生物合成等方面起到应答性的调控作用,天津医科大研究团队在快速心房起搏(rapid atrial pacing,RAP)犬模型的心房组织中探寻circRNA-miRNA网络,预测环状分子在离子通道活性和细胞骨架结构成分中起重要作用。莠去津(Atrazine, AZ)是一种环境内分泌干扰物,可以影响两栖动物发育过程。山东职业卫生研究中心研究团队通过比较AZ诱导发育异常组织和正常非洲爪蟾组织中环状分子的异常表达,推测环状分子可以参与wnt信号通路与孕酮介导的卵母细胞成熟信号通路。类似的,其他云序客户发表文章中还关注到了斑马鱼、鸡等其他物种当中环状RNA的重要生物学作用。circRNA分子呈封闭环状结构,不易被核酸外切酶RNaseR降解,比线性RNA更稳定。
ac4C RNA乙酰化是在RNA ac4C修饰酶的作用下,使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰(N4-acetylcytidine)。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上,导致Watson-Crick碱基热稳定性增加,调控蛋白合成中的编码准确性;近期研究发现ac4C分布在人类转录组中,大多数位点出现在编码序列(CDS)内,并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前,ac4C RNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”!circRNA的类型比想象的要复杂,可以来自基因组上多种基因结构。陕西ac4c环状测序
circRNA亦可直接通过局部碱基配对靶向mRNA。陕西m6a环状测序
云序专注于环状RNA研究,前期环状RNA筛选,云序提供全转录组及环状RNA测序相关服务;环状RNA验证,云序提供qPCR,RNaseR及Sanger测序等服务;文中环状RNA机制研究金钥匙——环状RNA Pull Down及RIP 环状RNA测序,云序均可提供全套服务!新年伊始,云序客户更是在环状RNA领域接连发表高分文章,包括世界首篇小鼠大脑创伤外泌体环状RNA文章;世界首篇非洲爪蟾环状RNA文章以及世界首篇红斑狼疮性肾炎环状RNA文章等等。云序致力于帮助客户在环状RNA研究领域占得先机,拔得头筹!陕西m6a环状测序
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