广东甲基化热点

植物中m6A修饰的研究主要集中在拟南芥的生长发育上。然而，拟南芥是一种盐敏感模式植物。因此，有必要对m6A修饰在高耐盐作物的盐胁迫响应中的作用进行研究。甜高粱是一种能源和饲料作物，非常适合在盐碱地生长。探讨m6A在甜高粱中的修饰对阐明作物的耐盐机理具有重要意义。在本研究中，作者检测了在耐盐性不同的两个高粱基因型(耐盐的M-81E和盐敏感的Roma)中m6A的修饰。甜高粱在盐胁迫下的m6A修饰发生了剧烈的变化，特别是在Roma中，一些耐盐相关转录本的m6A修饰增加，导致mRNA稳定性增强，进而参与了甜高粱耐盐性的调控。虽然m6A修饰对甜高粱的耐盐性具有重要的调控作用，但其调控活性受初始m6A修饰水平的限制。m7G RNA甲基化是在甲基化转移酶的作用下，使RNA鸟嘌呤（G）的第七位N上加上甲基的一种修饰。广东甲基化热点

云序生物对ac4C RNA乙酰化检测手段为acRIP-Seq技术，技术原理如下： 将乙酰化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有乙酰化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本只含有打断的RNA的片段，并不添加RNA乙酰化特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取的乙酰化片段的背景。对比免疫共沉淀（IP）样本和对照样本（Input）中的序列片段，将RNA乙酰化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，计算样本中RNA乙酰化程度及对RNA表达水平的影响。甲基化与基因表达2’-O-RNA甲基化是一种受RNA甲基化酶或纤维蛋白酶作用下。

案例：mRNA中胞嘧啶核苷乙酰化促进其翻译效率 原文：Acetylation of Cytidine in mRNA Promotes Translation Efficiency 期刊：Cell 影响因子：36.22 美国ai症研究所（NCI）和弗雷德里克实验室，发现下调NAT10（RNA乙酰化酶）能够抑 制Hela细胞的行为；并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修饰，下调NAT10后，ac4C的总体水平下降；为了进一步探究ac4C的功能，作者对WT和下调NAT10的Hela细胞进行acRIP-seq和mRNA测序，发现ac4C 的peak主要富集在mRNA的CDS区，同时下调NAT10能够降低ac4C在mRNA中的定点表达，并与靶mRNA的下调有很大关系；作者又进一步发现ac4C乙酰化修饰能够通过延长mRNA的半衰期并促进mRNA的稳定性，同时也能够通过ac4C peak中的密码子偏好性表达，决定并影响mRNA的解码效率，促进底物翻译。这些发现不仅扩大了mRNA修饰范围（包括乙酰化残基），也确立了ac4C在mRNA翻译调控中的作用。

在本研究中，作者对两个玉米(Zeamays)自交系转录组范围内的m6AmRNA分布和多聚体分析进行了平行分析，以评估m6A修饰与翻译状态的整体相关性。m6A位点普遍分布于数千个蛋白编码基因中，局限于一个共识基序内，主要富集于3’UTR区，且m6A修饰在调节替代聚腺苷酸位点的选择中发挥作用。更重要的是，m6A修饰根据其强度和基因位置显示了与翻译状态的多方面相关性。此外，在m6A修饰中观察到大量的种内变异，这种自然变异部分是由基因特异性表达和选择性剪接驱动的。总之，这些发现为鉴定玉米中受m6A修饰的转录本提供了宝贵的资源，并为更好地理解m6A在介导基因表达调控中的自然变异铺平了道路。RNA去甲基化可以提高水稻和马铃薯植株的产量和生物量。

案例2：2’-O-RNA甲基化酶FTSJ3协助HIV病 毒逃避宿主细胞免疫识别机制 原文：FTSJ3 is an RNA 2’-O-methyltransferase recruited by HIV to avoid innate immune sensing 期刊：Nature 影响因子：41.6 外国研究人员首先借助蛋白互作实验证实TRBP蛋白能够在不依赖于DICER酶的作用下与FTSJ3结合，形成复合物，因此推测，FTSJ3是一种2'-O-甲基化转移酶。接着，体外和体内实验表明FTSJ3就是一种通过TRBP被招募到HIV RNA上的2'-O-甲基化转移酶。通过优化的2’-O-RNA甲基化测序手段，证实在HIV病 毒遗传信息的特定位置上存在依赖于FTSJ3的2'-O-甲基化修饰。综上，该研究证实TRBP-FTSJ3复合物通过招募到HIV病 毒RNA发生2'-O-甲基化从而解释了HIV病 毒逃避宿主细胞先天免疫识别的机制。m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰。河南DNA甲基化

Nature正刊发表文章，证实发生m6A RNA甲基化修饰可以调控mRNA稳定性。广东甲基化热点

云序优势 单碱基分辨 m7G RNA甲基化单碱基测序方式，可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。 抗体富集效率高 m7G MeRIP测序方式，采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程，具有极高的效率和特异性。 高通量检测 可对全转录组范围内的m7G位点进行高通量地平行检测。 全分子覆盖 地对环状RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G位点进行检测。 一站式服务 客户需提供组织或细胞，云序生物一站式完成RNA抽提，样品预处理，建库，测序，数据分析流程。 专业的生物信息学分析 专业的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析需求广东甲基化热点

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