山西比色法检测整体甲基化

时间:2022年01月25日 来源:

近年来,科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A,即RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上发生甲基化修饰(N6-methyladenosine,m6A)。研究发现,m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰,m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。种种研究迹象表明m6A 存在于很多物种中,占到了 RNA甲基化修饰的80%。m6A除了分布在 mRNA 中,也出现在很多非编码 RNA中 ,如:环状RNA 、LncRNA等。Nature正刊发表文章,证实发生m6A RNA甲基化修饰可以调控mRNA稳定性。而随后Cell Research也发表文章,证实环状RNA也会被m6A甲基化修饰,并会促进环状RNA编码蛋白这一有趣的结论。采用类似ELISA抑 制竞争免疫的方法,实验样本和RNA甲基化标准品与RNA甲基化抗体共孵育。山西比色法检测整体甲基化

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技术简介 2’-O-RNA甲基化是一种受RNA甲基化酶或纤维蛋白酶作用下,核糖RNA在2’位置上发生甲基化的化学修饰。在哺乳动物、酵母、植物、病 毒等物种中普遍存在。已有研究表明,2’-O-RNA甲基化修饰在mRNA、tRNA、rRNA、miRNA等分子上分布。从结构上,2’-O-RNA甲基化通过提高核苷酸的疏水性,从而增强其稳定性。已有研究表明,2’-O-RNA甲基化影响mRNA与蛋白的结合、调控rRNA翻译效率、参与tRNA识别等生物过程。近年来,2’-O-RNA甲基化修饰作为一类新型RNA甲基化,高影响因子文章不断,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点。lncRNA甲基化文章云序生物为您带来一种基于酶学方法的 DNA 甲基化测序技术 EM-seq。

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云序生物提供两种m7G RNA甲基化测序服务:(1)m7G RNA甲基化单碱基测序,可对m7G修饰进行高通量检测和单碱基定位;(2)MeRIP测序,可通过m7G特异性抗体,抓取有甲基化修饰的片段进行测序,对m7G修饰进行高通量测序和peak峰定位。此外,云序生物针对m7G RNA甲基化开发了多款产品,可实现对mRNA、LncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G甲基化修饰水平的整体检测。 云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。

原文:METTL4 catalyzes m6Am methylation in U2 snRNA to regulate pre-mRNA splicing 期刊:Necleic Acids Research 影响因子:16.48 新加坡南洋理工大学的研究人员通过人类全转录组 RNA 甲基化测序,在 Mettl4 敲除组与野生型对照组之间寻找出 m6Am 相对甲基化水平的差异位点,其中 U2 snRNA 的第 30 位 RNA 残基有明显的 m6Am 修饰水平差异。进一步的 FLAG-tag 融合蛋白实验证明,METTL4 蛋白直接催化了 U2 snRNA 上的 m6Am 甲基化修饰的发生。METTL4 过表达实验发现,其催化的 RNA 内部 m6Am 修饰位点具有 HMAGKD 的序列 motif 特征(H=A/C/U, M=A/C, K=G/U, D=A/G/U)。 在 Mettl4 敲除的人类细胞中,因为 U2 snRNA 无法完成 m6Am 修饰,故而对 snRNA 的 pre-mRNA 剪接功能产生了诸多影响。而随后Cell Research也发表文章,证实环状RNA也会被m6A甲基化修饰。

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m6A修饰在植物中是必不可少的。在这里,作者证明了在水稻中表达转基因人RNA去甲基化酶FTO可以使温室条件下的粮食产量增加3倍以上。在田间试验中,转基因FTO在水稻和马铃薯中的表达使产量和生物量增加了约50%。此外,FTO的存在促进了根分生组织细胞增殖和分蘖芽的形成,提高了光合效率和抗旱性,但对成熟细胞大小、茎分生组织细胞增殖、根直径、株高或倍性没有影响。FTO介导了植物RNA中大量的m6A去甲基化(在poly(A) RNA中约7%的去甲基化,在非核糖体核RNA中m6A下降约35%),诱导染色质开放和转录激huo。因此,调控植物RNA m6A甲基化是一种很有前景的策略,可明显提高植物的生长和作物产量。核糖RNA在2’位置上发生甲基化的化学修饰。天津mRNA甲基化

研究表明,m7G RNA甲基化修饰存在于各类分子中。山西比色法检测整体甲基化

云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 样本要求: 样品类型: 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量: a) 细胞:2×107 b) 组织:100 mg-1 g c) RNA:30-300 μg(OD260/280:1.6-2.3;RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7) 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。山西比色法检测整体甲基化

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