浙江云序表观遗传组测序价格

时间:2022年11月28日 来源:

技术简介DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine,5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,一种新的DNA甲基化修饰类型—DNA-6mA甲基化已经成为表观遗传学领域的研究热点。云序生物率先开发了DNA-6mA测序技术—6mA-IP-seq。其原理类似于MeDIP的免疫共沉淀测序技术,利用特异性抗体富集6mA的片段,扩增后进行高通量测序及甲基化分析,以较小的数据量,快速地绘制全基因组DNA甲基化水平的图谱。血清、血浆、体液样品,液氮速冻后-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。浙江云序表观遗传组测序价格

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全基因组重亚硫酸盐测序法(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)一度是 DNA 5mC 测序的金标,可以将未经化学修饰的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),并在后续的扩增和测序过程中被读取为胸腺嘧啶(T),同时保持甲基化修饰的 5mC 和羟甲基化修饰的 5hmC 在测序中仍被读取为 C。然而,WGBS 法需要极端的温度和化学环境,容易造成 DNA 的断裂降解;并且,WGBS 法对未经化学修饰的胞嘧啶(C)具有高比例的破坏力,致使 GC 富集区相比于 AT 富集区更容易丢失,在测序文库中造成“GC 覆盖度偏误”。 由于 ctDNA 含量低、稳定性差,若采用 WGBS 法对 ctDNA 进行 5mC 测序,将会难以避免地带来很多负面影响: 经化学处理后所得的 DNA 总量低,难以满足测序文库所需的量; DNA 丢失严重,覆盖度低,容易造成测序缺口(gap); GC 检测覆盖程度不均一,未能反应真实情况。安徽项目表观遗传组测序研究通过Klenow酶修复转座产物的末端缺口。

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案例2 :鼻细胞表观基因甲基化作为儿童哮chuan和气道炎症生物标志物的研究 期刊:Nature Communication 影响因子:11.878 本文作者研究团队首先借助850K甲基化芯片平台对547名儿童鼻孔细胞表观基因组做了DNA甲基化检测分析,并对当前的哮chuan、变应原致敏、变应性鼻炎、呼出气一氧化氮(FeNO)和肺功能进行了鼻表观基因组关联分析(EWAS)。结果显示DNA差异甲基化主要发生在哮chuan相关基因、参与Th2和嗜酸性反应的基因、以及可能改变呼吸上皮的通透性和功能的基因。作者还发现发现随着过敏和哮chuan生物标志物的升高,表观遗传年龄会加速。综上所述,鼻细胞外基因组甲基化可以作为哮chuan、过敏和气道气道炎症的敏感生物标志物,以及这些表型的特异性生物学过程。

CUT&Tag 有望将蛋白与染色质 DNA 互相作用的研究变成了一种类似 PCR 反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有**性的意义 在生物学研究中,DNA 与蛋白质之间的相互作用(DNA-Protein Interaction, DPI)是至关重要的,基因的表达、调控、复制、重组和修复,RNA 的转运、翻译和调控,都离不开 DPI,几乎所有的生命活动都会涉及 DPI。 早在十九世纪后期,科学家就通过显微镜观察到了蛋白质与 DNA 直接的相互作用,从那以后,他们开始深入探索蛋白质结合并控制 DNA 的作用机制。目前,环状DNA不但可以作为一种新型特异的tumsour标志物。

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优势一:一站式服务。客户只需提供样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 优势二:超微量ctDNA 起始量要求。云序生物可以进行低至 10 ng 的 ctDNA 测序。 优势三:测序数据真实可靠。云序生物避免了传统 5mC 检测方法的 GC 覆盖度偏误,还拥有更完整的 DNA 读长,文库质量更加可靠。 优势四:严格质控流程:云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。 优势五:专业化生物信息分析:云序生物强大生物信息团队,满足客户个性化数据分析要求。文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。福建云序表观遗传组测序研究

NIPT之父卢煜明教授团队开发了一种环状DNA 甲基化分析的测序方案。浙江云序表观遗传组测序价格

CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,是新一代超微量ChIP-Seq技术,适用于无ChIP级别抗体的蛋白研究。与传统的ChIP-Seq研究方法相比,该技术无需交联、超声打断、末端抹平和接头连接等操作,因此具有省时高 效、所需的样品量少、背景信号低和可重复性好等优点,甚至可用于单细胞水平测序。CUT&Tag有望将蛋白质-DNA互作的研究变成一种类似PCR反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有**性的意义。浙江云序表观遗传组测序价格

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