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时间:2023年05月24日 来源:

研究一:环状RNA分子筛选及验证为探索造血干细胞功能相关的circRNA分子,作者比较了小鼠不同造血干细胞(LT-HSC,ST-HSC和MPPs)中全转录组变化情况,找出了156种明显性差异表达的circRNA分子,其中49种在LT-HSC中高表达。RNaseR及qPCR实验证实其中9种为真实LT-HSC中高表达环状RNA分子。为有效筛选造血干细胞相关的circRNA分子,作者通过体内circRNA干扰实验,发现只有干扰Cia-cGAS后才能明显影响小鼠体内造血干细胞亚群分布,并表现为LSK祖细胞数量明显增加,与此同时LT-HSC细胞数量明显减少。因此,作者结合转录组数据以及体内、体外验证实验,锚定Cia-cGAS分子进行后续分子机制研究。云序生物提供一站式环状RNA实时定量PCR技术服务。广东ac4c环状平台

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研究背景:利用高通量测序手段,研究者们在拟南芥、小鼠、果蝇和人体内都发现了环状RNA的高度表达,证明了环状RNA在不同物种中存在。目前,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限,环状RNA数据库circBase中已收录的物种有7个。作为一种重要的模式生物,非洲爪蟾的环状RNA尚未见报道。本文通过云序生物提供的一站式环状RNA测序、环状RNA定量PCR、环状RNA的RNaseR耐受性实验和生物信息学服务于全世界进行了非洲爪蟾环状RNA表达谱的构建,为后续研究脊椎动物环状RNA的生物学功能奠定了基础,非常具有借鉴意义。福建环状文章circRNA分子呈封闭环状结构,不易被核酸外切酶RNaseR降解,比线性RNA更稳定。

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环状RNA作为新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,其中大于10分的文章约60篇,是2018年的3倍左右。2019年关于环状RNA的国自然审批金额高达8000多万,环状RNA的火热程度可想而知。2020年国自然还未公布,但是小编预测环状RNA如果还是集中在吸附microRNA的ceRNA机制上,可能会造成**审美疲劳,影响中标率。环状RNA海绵机制并不是单一的环状RNA参与调控的机制。近期近期多篇关于环状RNA机制研究,揭示了环状RNA在tumour方向的研究进展。

为了更全检测小麦中所有环状RNA的表达情况,研究人员分别对PEG和水处理后的小麦幼苗叶子进行环状RNA测序,共发现了88条环状RNA。通过对环状RNA的基因组来源进行分析,发现环状RNA可分为5类,其中基因间(intragenic)产生的环状RNA占大多数。接下来,研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况,发现62条环状RNA差异表达,这暗示着这些环状RNA可能在脱水应激中发挥作用。为了验证测序结果的准确性,研究人员挑选了16条环状RNA,利用“divergentprimers”进行环状RNA定量PCR检测。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。

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胶质瘤作为较常见的颅内恶性tumour占颅脑tumour的40%~50%,电磁辐射等其他环境致cancer因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤医治手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的医治造成很大的困难。上海第二军医大学附属长征医院研究者通过环状RNA测序,从环状RNA角度对胶质瘤的发生和发展进行了研究, 共发现206个上调环状和1205个下调环状,其中扩大样本量qPCR验证(13例正常、68例疾病)后将目标锁定在circBRAF。该环状转录自BRAF基因,虽然在正常人样本当中BRAF基因编码的环状cricBRAF分子mRNA分子水平无明显差异,但是在疾病样本当中circBRAF有明显上调,KM曲线结合临床资料表明该环状的高表达能一定程度上预示着疾病的恶性程度和预后情况。可以翻译成蛋白质,但大部分是非编码RNA。河北修饰环状测序

越来越多的研究表明circRNA可发挥miRNA海绵或ceRNA的作用。广东ac4c环状平台

对于RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体的发展趋势,并非完全是市场的正常反应,因为市场有着阶段性和特殊性。RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体作为重要的新兴产业,仍然在“被看好”阶段,发展前景依然广阔。随着可视化技术的逐步完善与发展,产品间的差异化越来越小,工具整体所需具备的功能也愈发的明晰,使用门槛也在逐年降低。客户对于数据本身的价值越发看重。与工具性减弱相对应的,这正是服务型的加深。中国经济发展进入新周期,在未来增量市场向存量市场过度的过程中,RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体的重要性在逐步提升。从资产配置的角度来说,成熟市场模式中,RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体也是重要的配置方向。而当下,技术和消费变化,又给这个领域带来更多机会与挑战。RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体需求非常强,市场也非常大,只是还需要开发。RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体的比例高是IPO的极大卖点,该产品的兴起与浪潮无疑是毋容置疑的。现在RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体占20%左右比例,未来很快是50%比例。广东ac4c环状平台

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