海南服务表观遗传组测序

时间:2023年07月31日 来源:

在过去十年中,对非小细胞肺ai(NSCLC)的理解发生了重要的变化。现在证实,NSCLC具有不同的分子亚型。现在医生认为,针对NSCLC的个性化医治,应该是利用这些分子亚型匹配相对应的靶向疗法。表皮生长因子(EGFR)突变和ALK易位被认为是NSCLC医治很有效的靶点。但是EGFR和ALK的突变数量是多种多样的,并且我们检测到的突变类型还在不断地增加。因此,现代科学家们利用基于NGS的ctDNA技术,从患者血液中可以获得ROS1,BRAF,KRAS,HER2-,c-MET,RET,PIK3CA,FGFR1和DDR2的突变信息,从而利用这些突变信息为患者选择合适的靶向疗法。环状DNA连登《Nature》《Cell》等期刊,成为了很有潜力的科研新热点。海南服务表观遗传组测序

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不同于已经得到深入研究的基因组 DNA 的表观遗传修饰,ctDNA 的 5mC 甲基化修饰研究仍然是一个未被充分探索的领域,对于科研者来说是一个尚待挖掘的金矿。既然如此,那我们是不是可以按图索骥,直接将基因组 DNA 甲基化修饰研究的传统方法照搬到 ctDNA 的5mC 甲基化修饰研究上来呢?答案是否定的:因为 ctDNA 含量低、缺乏染色质结构的保护,若直接将研究基因组 DNA 的 5mC 修饰的传统方法应用于 ctDNA,则会遇到南橘北枳的困境,云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。福建云序表观遗传组测序分子云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。

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EM-seq的优势相比于传统的WGBS拥有多种优势:DNA测序文库质量高、所需DNA起始量小相比于WGBS,EM-seq对DNA的损伤小,因此可以用更少DNA样品、更少的PCR轮数扩增出高质量的测序文库。云序生物提供的EM-seq服务,所需的DNA起始量可低至10ng。DNA文库的插入片段更长、更完整相比于WGBS,EM-seq处理后的DNA的片段更完整,长度更长,避免产生测序缺口。出色的GC覆盖均一性无论GC程度高低,EM-seq的覆盖度都有均匀且优良的表现;相比之下,WGBS测序文库高估了AT区,却低估了GC区,造成“GC覆盖度偏误”。

优势一:一站式服务。客户只需提供样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。优势二:超微量ctDNA起始量要求。云序生物可以进行低至10ng的ctDNA测序。优势三:测序数据真实可靠。云序生物避免了传统5mC检测方法的GC覆盖度偏误,还拥有更完整的DNA读长,文库质量更加可靠。优势四:严格质控流程:云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。优势五:专业化生物信息分析:云序生物强大生物信息团队,满足客户个性化数据分析要求。而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。

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CUT&Tag 有望将蛋白与染色质 DNA 互相作用的研究变成了一种类似 PCR 反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有**性的意义 在生物学研究中,DNA 与蛋白质之间的相互作用(DNA-Protein Interaction, DPI)是至关重要的,基因的表达、调控、复制、重组和修复,RNA 的转运、翻译和调控,都离不开 DPI,几乎所有的生命活动都会涉及 DPI。 早在十九世纪后期,科学家就通过显微镜观察到了蛋白质与 DNA 直接的相互作用,从那以后,他们开始深入探索蛋白质结合并控制 DNA 的作用机制。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。广东分析表观遗传组测序平台

ctDNA羟甲基化检测为日后通过血浆样本进行无创诊断奠定了良好的基础。海南服务表观遗传组测序

CUT&Tag 是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,相较于传统的 ChIP-Seq 具有以下优点:省时高效、所需的细胞量少、背景信号低、可重复性好等优点,甚至可用于单细胞水平测序。CUT&Tag 有望将蛋白与染色质 DNA 互相作用的研究变成了一种类似 PCR 反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有**性的意义。 在生物学研究中,DNA 与蛋白质之间的相互作用(DNA-Protein Interaction, DPI)是至关重要的,基因的表达、调控、复制、重组和修复,RNA的转运、翻译和调控,都离不开 DPI,几乎所有的生命活动都会涉及 DPI。海南服务表观遗传组测序

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