宁夏修饰表观遗传组测序价格

时间:2023年07月31日 来源:

在过去十年中,对非小细胞肺ai(NSCLC)的理解发生了重要的变化。现在证实,NSCLC具有不同的分子亚型。现在医生认为,针对NSCLC的个性化医治,应该是利用这些分子亚型匹配相对应的靶向疗法。表皮生长因子(EGFR)突变和ALK易位被认为是NSCLC医治很有效的靶点。但是EGFR和ALK的突变数量是多种多样的,并且我们检测到的突变类型还在不断地增加。因此,现代科学家们利用基于NGS的ctDNA技术,从患者血液中可以获得ROS1,BRAF,KRAS,HER2-,c-MET,RET,PIK3CA,FGFR1和DDR2的突变信息,从而利用这些突变信息为患者选择合适的靶向疗法。环状DNA连登《Nature》《Cell》等期刊,彻底颠覆了人们对基因遗传的传统认知。宁夏修饰表观遗传组测序价格

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技术优势一站式服务:客户只需提供血清血浆,云序生物为您完成环状DNA富集,甲基化位点转化,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。一箭双雕的结果:同时检测环状DNA及其甲基化状况,节约样品,性价比高。专业的生物信息学分析:专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法,且能单碱基分辨甲基化修饰位点,满足客户的各类深入数据分析需求。样本要求样品类型:血清血浆或其它体液样品样品量:血清血浆:>5mL样品运输及保存:EDTA抗凝,样品干冰运输。勿用肝素管取样(绿色盖子抗凝管)。技术表观遗传组测序分析该技术可以同时检测环状DNA和环状DNA的甲基化修饰状态。

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ATAC测序的全称是AssayforTransposaseAccessibleChromatinusingsequencing,运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的一种技术。该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,进而获得在该特定时空下基因组中活跃转录的调控序列。这项技术只需少量细胞便可获得实时全基因组活性调控序列信息,应用于转录因子结合分析、核小体定位、活性调控元件分布等研究,在表观遗传机制研究领域有广阔的应用前景。云序生物对染色质开放区域进行研究的技术是利用ATAC测序技术,其原理为:利用DNA转座酶可以携带DNA去识别染色质开放区域。人为地将携带已知DNA序列标签的转座复合物(即带着测序标签的转座酶),加入到细胞核中,再利用已知序列的标签进行建库后测序,从而识别染色质的开放区域。

案例2:解析转录因子结合 原文:Cell-type specific and combinatorial usage of diverse transcription factors revealed by genome-wide binding studies in multiple human cells 期刊:Genome Research 影响因子:10.10 本文通过ChIP测序系统性地调查了11种不同类型人类细胞中3种转录因子(CTCF、RNAPII和MYC)与基因组的结合情况。结果表明:CTCF主要结合在基因间区,而RNAPII和MYC则偏向于结合在启动子区。CTCF结合位点在不同类型细胞中往往没有多大变化,而MYC的结合则呈现强烈的细胞特异性。MYC和RNAPII在很多区域共定位,并具有很多共同的靶基因。此外,通过整合转录组测序数据发现:转录因子结合与潜在靶基因的表达正相关,多个转录因子的组合结合,尤其是MYC和RNAPII的同时结合与基因高表达有着很强的关联性。ctDNA羟甲基化检测为日后通过血浆样本进行无创诊断奠定了良好的基础。

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早在去年 5 月,中国本土公司近岸蛋白质(NOVOPROTEIN)便公开了该方法替代 ChIP-Seq 的可能性与原料 ChiTagTM 酶(一种 Protein A 与 Tn5 融合蛋白)的技术原理(图1),展示了中国生物技术公司已经走出对国外公司的简单模仿,在某些领域的自主创新走在了世界的前列。Henikoff 博士的文章进一步展示了 ChiTag (Chromatin Immuno-Tagment) 酶在解决蛋白质-DNA 相互作用的巨大潜力。云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。云序生物率先推出ctDNA甲基化测序服务,需1ng ctDNA既可进行测序。中国香港修饰表观遗传组测序平台

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云序生物为您带来一种基于酶学方法的 DNA 甲基化测序技术 EM-seq(EnzymaticMethyl-seq),该方法结合使用多种酶,在保证 5mC 和 5hmC 在 Illumina 测序中仍被识别为 C 的前提条件下,将未发生修饰的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),并在后续的扩增和测序过程中被识别为胸腺嘧啶(T)。EM-seq 有效弥补了 Bis-Seq 需要极端反应条件的缺陷,可以普遍应用于包含 ctDNA 在内的微量脆弱 DNA 样品。同时,EM-seq 得到的测序结果与 WGBS 得到的转化序列相同,因此可以使用相同的数据分析流程。运用 EM-seq 技术,需低至 10ng 的 DNA 样品便可进行单碱基精度的全基因组 5mC 修饰测序。宁夏修饰表观遗传组测序价格

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