甘肃服务表观遗传组测序是什么

时间:2023年08月01日 来源:

报道表明:ctDNA羟甲基化不但可以作为tumsor分子标志物,还可用于追溯tumsor细胞的组织来源。在医疗大趋势下,ctDNA羟甲基化检测既具有极高的科研价值,又具备推进医疗临床实践的巨大潜能,为实现tumsor临床医治的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA羟甲基化测序,凭一管液体就可以进行tumsor诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等,是里程碑式的新型液体活检技术。云序生物率先推出ctDNA羟甲基化测序服务,低需1ngctDNA既可进行测序。客户需提供血浆,血清或体液样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。通过Klenow酶修复转座产物的末端缺口。甘肃服务表观遗传组测序是什么

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云序生物为您带来一种基于酶学方法的 DNA 甲基化测序技术 EM-seq(EnzymaticMethyl-seq),该方法结合使用多种酶,在保证 5mC 和 5hmC 在 Illumina 测序中仍被识别为 C 的前提条件下,将未发生修饰的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),并在后续的扩增和测序过程中被识别为胸腺嘧啶(T)。EM-seq 有效弥补了 Bis-Seq 需要极端反应条件的缺陷,可以普遍应用于包含 ctDNA 在内的微量脆弱 DNA 样品。同时,EM-seq 得到的测序结果与 WGBS 得到的转化序列相同,因此可以使用相同的数据分析流程。运用 EM-seq 技术,需低至 10ng 的 DNA 样品便可进行单碱基精度的全基因组 5mC 修饰测序。甘肃服务表观遗传组测序是什么可以预见的是,环状DNA将迅速成为新的科研热点。

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样本要求样品类型:细胞、组织、体液、总gDNA或IP后DNA。其它类型样品请详询。样品量:a)细胞5×108b)组织100mgc)IP后DNA10ngd)gDNA3μg样品运输及保存:样品运输:样品置于1.5mLEppendorf管中,封口膜封好,干冰运输,DNA可用冰袋运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块切块,液氮冻存后-80℃保存;DNA样品短期内可-20℃,避免反复冻融。云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。

案例1.ATAC-Seq与RNA-Seq关联分析期刊:ThePlantCell影响因子:8.23原文:EGRINs(EnvironmentalGeneRegulatoryInfluenceNetworks)inRiceThatFunctionintheResponsetoWaterDeficit,HighTemperature,andAgriculturalEnvironments本篇文章是利用ATAC-seq与RNA-seq联合分析的经典案例。作者选择5个不同的水稻品种,对它们分别进行热处理和干旱处理以模拟高温和缺水这2种胁迫环境。进一步通过对这种胁迫处理的5个水稻品种进行RNA-seq检测RNA的表达差异和ATAC-seq检测染色质开放区域差异。再联合ATAC-seq数据和RNA-seq数据,以及转录因子的motif信息。构建植物应激的转录因子-靶基因的调控网络图,并寻找关键的转录因子-靶基因模块,预测了关键转录因子活性。完成植物在应激情况下反应相关的转录因子的研究。后续进行文库构建与高通量测序,从而获得发生甲基化修饰的环状DNA。

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多次实验之间的一致性更高 EM-seq 文库在不同起始量之间的相关性都很高,表明 EM-seq 检出的数据具有很好的可重复性,且甲基化检测灵敏度不会随着起始量的减少而降低;相形之下,不同的 WGBS 文库之间的相关性就不够理想。更精准地检测转录起始位点的甲基化数据 在低表达基因的转录起始位点附近,胞嘧啶一般会发生甲基化修饰,但由于 WGBS 法倾向于低估 GC 区域,因此难免遗漏一些转录起始位点附近的甲基化修饰;EM-seq 因为其出色的 GC 覆盖均一性,可以更精准地检测转录起始位点的甲基化数。还在tumsour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。贵州文章 表观遗传组测序平台

促进tumsour细胞演进和适应性进化,增加了基因组的可塑性和不稳定性。甘肃服务表观遗传组测序是什么

云序优势一站式服务:客户只需提供细胞或组织,云序生物为您完成从样品准备、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。严格的质控:严格的质控是ChIP-Seq实验成功的前提。云序生物对ChIP-Seq实验的各个环节进行严格的质控,尽可能地降低实验风险。优化的ChIP流程:ChIP富集效率是ChIP-Seq成败的关键,云序生物采用商业化ChIP试剂盒和优化的实验流程,确保客户获得更好的数据。专业的生物信息学分析:云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求。甘肃服务表观遗传组测序是什么

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