陕西文章 表观遗传组测序研究

云序生物为您带来一种基于酶学方法的 DNA 甲基化测序技术 EM-seq（EnzymaticMethyl-seq），该方法结合使用多种酶，在保证 5mC 和 5hmC 在 Illumina 测序中仍被识别为 C 的前提条件下，将未发生修饰的胞嘧啶（C）转化为尿嘧啶（U），并在后续的扩增和测序过程中被识别为胸腺嘧啶（T）。EM-seq 有效弥补了 Bis-Seq 需要极端反应条件的缺陷，可以普遍应用于包含 ctDNA 在内的微量脆弱 DNA 样品。同时，EM-seq 得到的测序结果与 WGBS 得到的转化序列相同，因此可以使用相同的数据分析流程。运用 EM-seq 技术，需低至 10ng 的 DNA 样品便可进行单碱基精度的全基因组 5mC 修饰测序。专业的生物信息学团队，开发了高效识别分析环状DNA的算法。陕西文章 表观遗传组测序研究

技术简介DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一，我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化（5-methylcytosine,5mC），却不知道随着测序技术的快速发展，一种新的DNA甲基化修饰类型—DNA-6mA甲基化已经成为表观遗传学领域的研究热点。云序生物率先开发了DNA-6mA测序技术—6mA-IP-seq。其原理类似于MeDIP的免疫共沉淀测序技术，利用特异性抗体富集6mA的片段，扩增后进行高通量测序及甲基化分析，以较小的数据量，快速地绘制全基因组DNA甲基化水平的图谱。吉林表观遗传组测序价格这种形式的DNA被称为环状DNA (extrachromosomal circular DNA）。

技术优势一站式服务：客户只需提供样本，云序生物为您完成从ctDNA提取，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。特异性富集ctDNA的片段：云序生物具有丰富样本处理经验，采用ctDNA提取试剂盒，富集效率高。严格质控流程：云序生物质控流程严格，层层把关，为客户提供高准确度的结果。专业化生物信息分析：云序生物强大生物信息团队，满足客户个性化数据分析要求。样本要求1）样品类型：血清、血浆、体液等。其他样本类型请详询。2）样品量：血清，血浆：≥5mL;体液：请详询。3）样品保存：血清、血浆、体液样品，可用液氮速冻后-80℃保存，样品保存期间避免反复冻融。4）样品运输：样品置于1.5mL管中，封口膜封好，干冰运输。

案例：hMeDIP-seq揭示了心机细胞发育与肥大过程中的基因表达与5hmC有关 DNA hydroxymethylation controls cardiomyocyte gene expression in development and hypertrophy[J].Greco C M, Kunderfranco P, Rubino M, et al . Nature Communications, 2016, 7:12418. 5-hmC（DNA羟甲基化）在基因体上富集能够激huo基因的转录调控，但对启动子和远端调节区的功能不太清楚。本文主要是以不同发育时间点和心肌肥大的心肌细胞为实验载体，主要剖析5-hmC在心肌细胞（CMC）基因组中的分布，并揭示了5-hmC在心脏发育和疾病中的作用机制。1）通过DNA羟甲基化测序，作者发现在心脏发育过程中，CMCs中的5-hmC在基因间区域逐渐减少，并向GB上富集（图1）。2）通过DNA羟甲基化和转录组关联分析，作者得出5-hmC是CMCs发育和肥大过程中的重要调控因子（图2）。还在tumsour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。

可以说，ctDNA的应用已经渗透到tumsor全程管理的各个环节。早期筛查：与甲基化检测结合，或能较早检出tumsor的发生；技术不断成熟，有望使其成为tumsor早筛的新方法。分子诊断：用于组织学检测的替代或有效补充，检测已知的驱动基因，如肺cancerEGFR、ALK突变等，指导医治。残余病灶检测：可基于ctDNA，进行术后分子残留病灶检测，并进一步预测巩固医治的疗效。疗效评估：系列、动态的检测ctDNA中的基因突变情况（如EGFR突变丰度），有效评估tumsor通路状态，评估靶向医治的疗效。但新的研究表明：无论是在正常体细胞还是ai细胞中，都存在大量染色体外环状DNA。黑龙江云序生物表观遗传组测序结果

通过Klenow酶修复转座产物的末端缺口。陕西文章 表观遗传组测序研究

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