河西区m1A测序
m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。研究表明,m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。与m6ARNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,抗体富集的技术原理如下:将m1ARNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。Nature:真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究。河西区m1A测序
为了探究m6A保守序列在不同组织之间和发育阶段之间的差异,RRACH保守序列被细分为4种子序列。对比胎儿和成年人的组织,发现心脏、肾和肺组织中m6A保守序列比例发生变化,而肝和肌肉在成年前后m6A保守序列比例相对不变。对比不同组织中的保守序列发现,AAACH和GGACH两种保守序列的比例在组织间差异较大,且同时含有这两种序列的m6A峰的数目明显低于随机重排后分析出的预测数目,暗示了这两种保守序列可能是由不同的甲基化酶亚基互作用蛋白来识别的。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,河西区m1A文章Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰 m1A。
在m1A领域,云序生物是国内一家有文献发表的测序服务平台。2020年8月,云序客户在Plantphysiology发表了矮牵牛m1A甲基化修饰文章,其中的m1A测序和相关数据分析均由云序提供。这个新领域的研究进展如何?有哪些新型的方法思路值得我们借鉴呢?小编汇集了近期多篇m1A修饰文章,带大家把握这一领域的前沿进展。1.m1A——矮牵牛mRNA中m1A修饰的动态变化(云序客户文章),2.对不同RNA修饰调控作用的新见解:重新定义转录和翻译之间的桥梁,3.m1A——寡核苷酸质谱法guang泛的应用于体外分析甲基化酶和去甲基化酶。
此研究由云序生物合作客户华南农业大学余义勋课题组完成的,该课题组利用m1A-seq&RNA-seq(本实验云序提供)技术对矮牵牛花瓣中含m1A修饰的RNA进行全转录组分析,发现乙烯处理降低了花瓣mRNAm1A峰的水平。另外还发现矮牵牛tRNA特异性甲基转移酶61A(PhTRMT61A)的沉默降低了体内和体外mRNA的m1A水平,定位于细胞核内的PhTRMT61A被抑制会导致叶片发育异常。这些研究结果显示RNAm1A修饰可以作为表观转录组调控机制并在植物生长发育中起着重要作用。矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,云序生物热门RNA修饰—m5C甲基化。RNA甲基化位点motif分析。
该研究还表明,位于5’UTR区,尤其是转录本di一和第二位上的m1A可促进mRNA翻译,而位于编码区的m1A可抑制翻译作用。因此,m1A测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A甲基化修饰,还为进一步m1A甲基化功能验证提供了重要工具。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。云序生物作为m1ARNA甲基化研究的先驱者,能够为客户提供专业和优zhi的m1ARNA甲基化测序服务。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,m6A/m1A/m5C RNA甲基化定量检测试剂盒。密云区修饰m1A
云序客户|华南农业大学余义勋课题组揭示植物RNA m1A修饰调控机制。河西区m1A测序
01m1ARNA修饰测序,m1ARNA修饰测序(m1A-seq),对m1ARNA甲基化,目前流行的检测手段为m1A-Seq技术,适用于m1ARNA甲基化谱研究,快速筛选m1ARNA甲基化靶基因。云序可提供mRNA和多种非编码RNA的m1A测序:m1A全转录组测序(涵盖mRNA,LncRNA,circRNA),m1A LncRNA测序(涵盖LncRNA和mRNA),m1A Pri-miRNA测序(涵盖Pri-miRNA和mRNA),m1A mRNA测序。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。河西区m1A测序
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