北辰区m1Apri-miRNA测序

时间:2023年08月10日 来源:

该研究还表明,位于5’UTR区,尤其是转录本di一和第二位上的m1A可促进mRNA翻译,而位于编码区的m1A可抑制翻译作用。因此,m1A测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A甲基化修饰,还为进一步m1A甲基化功能验证提供了重要工具。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。云序生物作为m1ARNA甲基化研究的先驱者,能够为客户提供专业和优zhi的m1ARNA甲基化测序服务。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量,发现其存在于各种细胞系中。北辰区m1Apri-miRNA测序

北辰区m1Apri-miRNA测序,m1A

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m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucleic Acid Research (IF=11.147)杂志上发表了一篇文章Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human, 通过对9种人类组织的m6A测序,分析了m6A甲基化位点在不同组织中的分布特点、潜在调控机制和进化。

这一分布规律与m6A(真核细胞mRNA中广fan的甲基化修饰)截然不同,后者主要集中在mRNA的靠后一个外显子上,并且对mRNA的翻译、定位、稳定性等多个过程进行调控。该研究进一步鉴定了m1A修饰的一个去甲基化酶ALKBH3,并发现了转录组中ALKBH3的近千个作用位点。因此,该研究不但揭示了m1A的广fan存在、绘制了转录组中m1ARNA修饰的谱图,也为m1A修饰参与基因表达调控的研究提供了重要工具。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,m1a全转录组测序,上海云序生物更专业。

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2.m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测,发现了740个m1A修饰位点,其中473个位点位于mRNA和lncRNA,大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库,作者还排除了假阳性结果。另外,作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关,且这种正相关性在cap+1位置上更xian著,但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析,作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外,作者发现TRMT6/61A不仅是tRNAm1A甲基化酶复合物,也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰m1A  ,云序生物。河东区m1ARNA甲基化测序

RNA甲基化富集峰分布图。北辰区m1Apri-miRNA测序

m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。研究表明,m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。与m6ARNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,抗体富集的技术原理如下:将m1ARNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。北辰区m1Apri-miRNA测序

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