全 甲基化与基因表达

时间:2023年08月02日 来源:

原文:METTL4catalyzesm6AmmethylationinU2snRNAtoregulatepre-mRNAsplicing期刊:NecleicAcidsResearch影响因子:16.48新加坡南洋理工大学的研究人员通过人类全转录组RNA甲基化测序,在Mettl4敲除组与野生型对照组之间寻找出m6Am相对甲基化水平的差异位点,其中U2snRNA的第30位RNA残基有明显的m6Am修饰水平差异。进一步的FLAG-tag融合蛋白实验证明,METTL4蛋白直接催化了U2snRNA上的m6Am甲基化修饰的发生。METTL4过表达实验发现,其催化的RNA内部m6Am修饰位点具有HMAGKD的序列motif特征(H=A/C/U,M=A/C,K=G/U,D=A/G/U)。在Mettl4敲除的人类细胞中,因为U2snRNA无法完成m6Am修饰,故而对snRNA的pre-mRNA剪接功能产生了诸多影响。m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰。全 甲基化与基因表达

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案例1:哺乳动物mRNA内m7G甲基化转录组图谱 期刊:Molecular Cell 影响因子:14.25 由于全部种类的反转录酶均无法将RNA m7G位点逆转录成对应发生碱基突变的cDNA,为了准确的探究RNA内m7G甲基化情况,何川团队利用m7G自带正电荷的特征,开发了新的m7G单碱基深度测序方法。该方法能够将RNA内含m7G位点转化为另一种可产生反转录碱基变异的新位点,并依据碱基变异率估计m7G位点的甲基化水平。此方法随后也被证实可检测18S rRNA中的1639位内含m7G位点以及可揭示人类细胞tRNA中的22个46位内含m7G位点。并观测到其在mRNA分布、富集的共有序列及其它统计特征与m7G-MeRIP-seq数据基本保持一致。该文章不仅揭示了m7G甲基化在人类细胞中的分布特征,同时还发现METTL1是一种甲基转移酶,它在mRNA中催化了m7G甲基化修饰,并表明m7G的内部甲基化可以影响mRNA的翻译。贵州m5C RNA甲基化环状RNA也会被m6A甲基化修饰,并会促进环状RNA编码蛋白这一有趣的结论。

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云序优势单碱基分辨m7GRNA甲基化单碱基测序方式,可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。抗体富集效率高m7GMeRIP测序方式,采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。高通量检测可对全转录组范围内的m7G位点进行高通量地平行检测。全分子覆盖地对环状RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G位点进行检测。一站式服务客户需提供组织或细胞,云序生物一站式完成RNA抽提,样品预处理,建库,测序,数据分析流程。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求

m6A甲基化已经被证明与植物对病原体的抗性有关。然而,小麦(Triticumaestivum)全转录组m6A谱及其在小麦抗小麦黄花叶病毒(WYMV)中的潜在生物学功能尚未见报道。这项研究是shou次鉴定两个不同抗WYMV小麦品种的转录组m6A修饰谱。通过对m6A-MeRIP-seq数据的分析,作者在WYMV感ran的抗病小麦品种(WRV)和WYMV感ran的敏感小麦品种(WSV)中鉴定出25752个共有m6A峰和30582个共有m6A基因,这些峰主要富集在编码序列3‘UTR区和终止密码子中。GO分析和RNA测序数据显示,m6A和mRNA水平均发生明显变化的基因与植物防御反应有关。将甲基化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育。

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RNA甲基化相关酶在特殊发育时期发挥重要作用。全 甲基化与基因表达

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